يعود العميل الأسطوري في جهاز NCIS، سام هانا، إلى مكتبه الميداني في مسقط رأسه بمدينة نيويورك، حيث يتعاون مع عميل متمرد لقيادة فريق جديد في مهام بالغة الأهمية تهدف إلى حماية واحدة من أكثر مدن وموانئ العالم حيوية.